Simulation des HIV-1-Viruszyklus mit Fortran 90 / C++

Die Replikation des HIV-Virus ist ein zeitlicher Prozess, der die Anheftung an die Wirtszelle und die Fusion, die reverse Transkription, die Integration in die DNA der Wirtszelle, die Transkription und das Spleißen, den Transport mehrerer mRNAs, die Proteinsynthese, die Knospung und die Reifung umfasst. Die Long-Read-Sequenzierung wurde auf das Genom des HIV-1-Virus (Typ HXB2CG) mit der Software HIV.pro angewandt, einem Fortran-90/C++-Code zur Simulation des Virusreplikationszyklus, insbesondere der RNAPII-Transkription, des Exon/Intron-Spleißens und der Ribosomenproteinsynthese, einschließlich des Frameshifts am gag/pol-Gen und der Ribosomenpause am env-Gen. Die detaillierte Analyse der HIV-Virusreplikation und die Charakterisierung der Virusproteomik sind wichtig, um zu ermitteln, welche Antigene von Makrophagen an CD4-Zellen präsentiert werden, um reaktive Epitope zu lokalisieren oder um Transfervektoren für die Entwicklung neuer HIV-Impfstoffe und wirksamer Therapien zu schaffen.