Secuenciación y caracterización genética

El plátano (género Musa) es un importante cultivo económico y alimentario. Las plantas de plátano son atacadas por muchos patógenos bacterianos, fúngicos y virales. Uno de los patógenos virales más importantes del plátano es el virus del racimo del plátano (BBTV), que causa la enfermedad del racimo del plátano (BBTD). En India, la industria del plátano se enfrenta al problema del BBTV desde finales de los años 80, cuando una grave epidemia causó drásticas pérdidas económicas. El genoma del BBTV comprende al menos seis componentes integrales de moléculas circulares de ADN monocatenario (cssDNA), cada una de aproximadamente 1 Kb de tamaño. El BBTV pertenece al género Babuvirusin Nanoviridae, una de las tres familias de virus de ADNcss. Lo transmite el pulgón negro del plátano Pentalonia nigronervosa Coq. La información sobre el BBTV en Kerala es limitada. Es esencial aislar y caracterizar el virus que infecta los cultivos de banano en Kerala. Para caracterizar el BBTV de Kerala, el ADN-R de un aislado de varios distritos de Kerala fue amplificado con PCR, clonado y secuenciado. El análisis de los componentes genómicos del ADN-R reveló subgrupos de BBTV en Kerala. Sobre la base del ADN-R, los aislados de Kerala pertenecen al subgrupo del Pacífico Sur.