Peptidomimetyczne bloki konstrukcyjne

Znanym przykladem interakcji regulacyjnej RNA-bialko jest kompleks TAR-RNA HIV-1 i bialko wirusowe Tat. Ten kompleks jest ważny dla skutecznej transkrypcji genomu wirusa. Znajomośc zasad rozpoznawania Tat to TAR RNA powinna umożliwic projektowanie konkretnych ligand w, kt re mogą atakowac jako antiviralni antagoniści Tat. Celem pracy byla synteza ligand w RNA do syntezy peptyd w fazy stalej (FPPS) w oparciu o heteroaromatyczne bloki konstrukcyjne. Podobieństwa wiążące peptyd w i malych cząsteczek z FPPS do TAR RNA HIV-1 określono metodą fluorescencyjną i fluorescencyjną spektroskopią korelacyjną (FCS). Badania NMR i dynamiczne obliczenia molekularne umożliwily wykrycie zmiany konformacyjnej w TAR RNA. Wlaściwości przeciwwirusowe peptyd w i malych cząsteczek określono metodą oznaczania kom rek HeLa P4. Kolejnym celem pracy bylo zbadanie koncepcji wiązania i wlaściwości przeciwwirusowych diaminopyrazoli i indazoli.