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Beskrivelse
La virulence de la bactérie Gram+ Bacillus anthracis (maladie du charbon) est due à une capsule et deux toxines. La toxine oedémateuse EF est une adénylyl cyclase, qui transforme l'ATP en AMPc de manière incontrôlée, provoquant des dérèglements cellulaires. Elle est activée par la calmoduline (CaM), senseur du calcium. Des structures cristallographiques et une étude par RMN ont montré que la stabilité du complexe EF-CaM dépend du niveau de calcium fixé à CAM. Des simulations de dynamique moléculaire du complexe ont permis de caractériser l'effet du calcium et de proposer un modèle de l'interaction EF-CaM. Une analyse conjointe des contributions dynamiques et énergétiques a fait émerger le concept de connexité du réseau de résidus. Un chemin de réaction plausible a été déterminé pour décrire la transition de EF. Les conformations intermédiaires obtenues ont servi à guider la recherche rationnelle d'inhibiteurs de la toxine EF, dans le cadre d'une approche combinant méthodes computationnelles et expérimentales. Une stratégie innovante, impliquant le criblage virtuel d'une poche allostérique, a identifié six molécules actives, inhibant totalement l'activité de EF à 10-100 microM.
