Genetische populatiestructuur

De diepzeegarnalen Haliporoides triarthrus en de langoustines Metanephrops mozambicus zijn endemisch in het gebied van de Zuidwestelijke Indische Oceaan (SWIO) en maken het grootste deel uit van de trawlvangsten van diepzeeschaaldieren in Mozambique en Zuid-Afrika. Ondanks hun economisch belang voor deze visserijen is er weinig bekend over hun verspreiding, biologie en genetische populatiestructuur. De genetische variatie van de metapopulatie van H. triarthrus en M. mozambicus werd beoordeeld aan de hand van 220 specimens per soort, verzameld op drie plaatsen in Mozambique (Bazaruto A, Boa Paz en Inhaca), twee plaatsen in West-Madagaskar (Morombe en Tulear) en één plaats in Oost-Zuid-Afrika (Durban). Twee fragmenten van de mitochondriale regio werden geamplificeerd met behulp van universele primers ribosomale 16S-subeenheid (16S) en mitochondriale cytochrome oxidase-subeenheid I (COI). Van H. triarthrus werden fragmenten van 569 basisparen (bp) (16S) en 1300 bp (COI) geamplificeerd. In totaal werden 207 sequenties (16S) en 151 sequenties (COI) teruggevonden, en respectievelijk 69 en 78 haplotypes geïdentificeerd. De 16S- en COI-genen van Metanephrops mozambicus leverden vergelijkbare fragmentlengten op, en er werden 112 (16S) en 127 haplotypen (COI) teruggevonden.