DNA Barcoding: Cinnamomum Schaeffer filippino (Lauraceae)

Le 27 specie raccolte sono state sottoposte a isolamento del DNA, reazione a catena della polimerasi e sequenziamento del DNA. Un CTAB modificato ha isolato con successo il DNA delle specie. L'amplificazione con rbcL e master mix ha fornito 36 buoni DNA da 45 campioni. I risultati di BLAST sono stati dall'86% al 100% di identità massima. L'analisi MEGA 7 ha portato al cluster 1 composto da 34 individui in 22 specie con un supporto bootstrap del 75%. Quattro sottocladi sono stati formati nei cladi principali e quattordici piante individuali sono rimaste da sole come singleton.Il cluster 2 è composto da due specie come due singleton.I rami bootstrap sono tutti superiori al 50%, il più basso al 60% e il più alto al 75%.Alcune delle specie hanno mostrato divergenza genetica.I 36 campioni di DNA appartengono solo a 14 aplotipi in 140 siti nucleotidici.L'aplotipo 1 ha 18 campioni composti da 12 specie.Ha confermato che tutti gli individui sono specie di Cinnamomum. Specie simili situate in siti geografici diversi presentano lievi differenze nelle sequenze di DNA.